(1)感染因素:本病的病理變化和臨床表現與細菌性痢疾非常相似，有些病例可以在糞便中培養細菌，有些病例使用抗生素有效，因此感染是本病的原因。但而，經過多年的反復研究，我們還沒能直接找到微生物感染的依據。潰瘍性結腸炎患者約有0.5%到8.2%的患者痢疾轉變，也有人建議與自己的免疫有關。
（2）精神因素：由于精神障礙引起植物神經功能失調，隨之出現腸道運動亢進、肌肉痙攣、血管收縮、組織缺血、毛細血管通透性增加等，最終導致腸壁炎癥及潰瘍形成。
(3)遺傳因素:在歐美，本病發病率高，家庭性明顯，種族間發病率明顯不同，建議本病可能與遺傳有關。
（4）大腸內酶的局部因素：腸壁分泌過多的溶菌酶、蛋白質分解酶等，破壞了粘液的保護作用，因而導致細菌的侵入，發生粘膜壞死。
（5）過敏反應：某些食物（如牛奶）可使少數病例病情復發。
（6）防御機能障礙。
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