1、異位妊娠（宮外孕）：異位的子宮內膜可以引起盆腔粘連，輸卵管運行障礙，受精卵只有在局部種植發育，導致異位妊娠的概率增加。
2、女性不孕癥：占子宮內膜異位癥的40%-50%。內異癥可使盆腔粘連、輸卵管堅硬甚至梗阻、激素的代謝功能異常及免疫功能異常，導致孕卵逆行與子宮內膜不同步，或使孕卵本身逆行受阻而發生不孕。
3、疼痛：以下腹及腰骶部疼痛最為明顯，常于月經來潮前1—2天開始，經期專業天最嚴重，以后逐漸減輕。但是隨著病期的延長，經期腹痛會更加明顯。另外，性交時因受陰莖抽動的影響，也會引起疼痛，以月經前期較為明顯。
4、月經不調：受異位的子宮內膜侵犯，卵巢實質組織被破壞，使激素代謝受影響，出現月經紊亂和經期陰道流血增多，個別還會出現經前期點滴出血。
5、卵巢腫瘤：卵巢是異位的子宮內膜最愛“居住”的場所，每當月經來潮，經血總會在卵巢存留，而且會越存越多，慢慢地包塊就不知不覺地形成了，隨著月經周期的變化，包塊可以時大時小，包塊里面存積的血液漸漸增加，由于存積的血液日久變質，紅細胞被破壞，故當切開包塊時，所見的內容物酷似巧克力，這在醫學上稱為“巧克力囊腫”。
6、子宮增大：子宮內膜可以“移位”到子宮肌壁內，使子宮增大，每當月經來潮時，子宮肌壁間的內膜也受激素的影響，發生出血，引起疼痛，非常痛苦。
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