鼻咽癌的診斷應做如下檢查：
(一) 前鼻孔鏡檢查
鼻黏膜收斂后，經前鼻孔鏡可窺到后鼻孔和鼻咽部，能發現侵入或鄰近鼻孔的癌腫。
(二) 間接鼻咽鏡檢查
方法簡便、實用。應依次檢查鼻咽的谷璧，汪怠鼻咽頂后壁及兩側咽隱窩，要兩側相應部位對照觀察，凡兩側不對稱的黏膜下隆起或孤立性結節更應引起注意。
（三）纖維鼻咽鏡檢查
進行纖維鼻咽鏡檢查可先用1%麻黃素溶液收斂鼻腔黏膜擴張鼻道。再用1%地卡因溶液表面麻醉鼻道，然后將纖維鏡從鼻腔插入，一面觀察，一面向前推進，直到鼻咽腔。本法簡便、鏡子固定好，但后鼻孔和頂前壁觀察不滿意。
（四）頸部活檢
對已經鼻咽活檢未能確診的病例可進行頸部腫塊活檢。一般均可在局麻下進行，術時應選擇最早出現的硬實淋巴結，爭取連包膜整個摘出。如切除活檢確有困難，可在腫塊處作楔形切取活檢，切取組織時須有一定深度，并切忌擠壓。術畢時術野不宜作過緊過密的縫合。
（五）細針穿刺抽吸
這是一種簡便易行，安全高效的腫瘤診斷方法，近年來較為推崇。對疑有頸部淋巴結轉移者可首先使用細針穿刺取得細胞。具體方法如下：
1.鼻咽腫物穿刺。用7號長針頭接于注射器上。口咽部麻醉后，在間接鼻咽鏡下將針頭刺入腫瘤實質內，抽取注射器使成負壓，可在腫瘤內往返活動兩次，將抽取物涂于玻片上做細胞學檢查。
2.頸部腫塊的細針穿刺。用7號或9號針頭接于10ml注射器上。局部皮膚消毒后，選擇穿刺點，沿腫瘤長軸方向進針，抽吸注射器并使針頭在腫塊內往返活動2-3次，取出后將抽吸物做細胞學或病理學檢查。
（六)EB病毒血清學檢測
目前普遍應用的是以免疫酶法檢測EB病毒的IgA/VCA和IgA/EA抗體滴度。前者敏感度較高，準確性較低；而后者恰與之相反。故對疑及鼻咽癌者宜同時進行兩種抗體的檢測，這對早期診斷有一定幫助。對IgA/VCA滴度≥1：40或IgA/EA滴度≥1：5的病例，即使鼻咽部未見異常，亦應在鼻咽癌好發部位取脫落細胞或活體組織檢查。如一時仍未確診，應定期隨診，必要時需作多次切片檢查。
（七）鼻咽側位片、顱底片及CT檢查
每例患者均應常規作鼻咽側位照片和顱底照片。疑及鼻旁竇，中耳或其他部位有侵犯者，應同時作相應的攝片檢查。有條件的單位應作CT掃描了解局部擴展情況，特別需要掌握的是咽旁間隙的浸潤范圍。這對于確定臨床分期以及制定治療方案都極為重要。
（八)B型超聲檢查
B型超聲檢查已在鼻咽癌診斷和治療中廣泛應用，方法簡便，無損傷性，患者樂意接受。在鼻咽癌病例主要用于肝臟、頸、腹膜后和盆腔淋巴結的檢查，了解有無肝轉移和淋巴結密度、有無囊性等。
（九）磁共振成像檢查
由于磁共振成像(MRI)可清楚顯示頭顱各層次、腦溝、腦回、灰質、白質和腦室、腦脊液管道、血管等，用SE法顯示T1、T2延長高強度圖像可以診斷鼻咽癌、上額竇癌等，并顯示腫瘤與周圍組織關系。
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