因為不育的原因很多，所以治療必須抓住主要矛盾，一般應盡可能在未懷孕時查明有無流產的因素，并予以糾正，而在妊娠期則爭取及早發現可能即將發生流產的情況而加以處理。
如果病因在女性生殖器官的，應用敏感的抗菌藥物，控制子宮內膜炎癥，并預防復發，選用孕激素或丹那哇治療子宮內膜異位癥。用女性激素治療子宮發育不良。
如果病因在子宮畸形、子宮位置異常、腫瘤、宮頸管裂傷、宮頸內口功能不全等則要采用手術治療。但手術都應謹慎考慮。如對子宮位置異常，除因子宮粘連而后曲以外，。因效果不理想，故不積極主張手術。對子宮畸形，因有些人仍能正常妊娠和分娩，所以只有子宮畸形是娠妊不育的唯一原因，或有習慣性流產并強烈要求生育的才考慮手術。對于卵巢腫留或可能影響孕育的子宮肌瘤應手術切除腫瘤，因流產，人工流產或分娩后發生的宮腔粘連，雖可分離粘連，并放置避孕環2~3個月，以減少官腔粘連，但治療后的妊娠率仍較低，且妊娠及分娩時并發癥較多。
因內分泌混亂引起者，如病因為卵巢功能不正常，可有計劃地用雌激素和孕激素做人工月經周期治療，但應經常測定血中激素情況以評定療效。如病因在甲狀腺、腎上腺或胰腺的也應予以相應的治療。
對胎兒方面的因素或夫婦染色體異常引起的流產和不育，到目前為止，尚無理想的治療方法。
對夫婦(或母兒)之間血型不合引起者，因血型已定，不能自行控制或改變，只能在孕期嚴密觀察。一旦發現孕婦血中出現免疫抗體，應立即進行積極治療。通常讓孕婦安靜、休息，并服用維生素C、E、K及保肝藥物。
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